Det samlade indexet (Composite PMI) sjönk till 52,8 i juni, jämfört med 53,5 föregående månad. Förväntningarna pekade mot ett index på 53,4 enligt Bloomberg News prognosenkät.

Inköpschefsindex för tillverkningsindustrin sjönk till 51,9, jämfört med 52,2 föregående månad. Analytiker hade väntat sig ett index på 52,2.

Inköpschefsindex för tjänstesektorn sjönk till 52,8 jämfört med 53,2 föregående månad. Analytiker hade väntat sig ett index på 53,3.

Chris Williamson, chefekonom vid Markit, noterade i en kommentar att PMI den ekonomiska tillväxten i euroområdet bromsade in för andra månaden i rad.

"Juni-PMI rundade av det starkaste kvartalet på tre år, men ett orosmoment är att detta innebar den andra raka månaden med indexfall, vilket signalerar att euroområdets återhämtning tappar momentum", sade han.

Han sade att förhoppningen nu är att ECB:s nya stimulanser kan få fart på tillväxten igen. Det kan redan finnas tecken på det eftersom vi såg det största inflödet av ny affärsverksamhet på tre år i juni.

"Oro kring deflation kommer också till viss mån att slätas ut då priserna endast föll väldigt marginellt, med den lägsta prisminskningen på två år. Detta kan dock till viss del hänföras till högre kostnader, framförallt högre oljepriser", sade han.