"Vi anser att det fortfarande finns utrymme i den befintliga budgeten vad gäller flexibel användning av resurser så att de 3 miljarderna täcks helt utan att be medlemsländerna om mer bidrag", sade den italienske finansministern Pier Carlo Padoan vid en presskonferens på fredagen.
Italien vill också ha mer information om hur pengarna ska användas.
EU-toppmötet i december enades om att EU-budgeten ska stå för 1 miljard och EU-länderna för 2 miljarder euro.
Ekofinmötets ordförande, Nederländernas finansminister Jeroen Dijsselbloem, sade att det fanns ett brett stöd bland finansministrarna för att ärendet brådskade.
"Det fanns en mycket stark känsla att vi behöver denna facilitet och det snabbt. Jag hoppas att Italien kan lyfta sin reservation mycket snart", sade han.
Bättre mottagning av syriska flyktingar i Turkiet är tänkt att minska inflödet till EU.
Tyske finansministern Wolfgang Schäuble sade att mer pengar än 3 miljarder euro kommer att behövas framöver för att hantera flyktingkrisen.
Fredagens ekofinmöte diskuterade också om EU-länder ska få utöka omvänd momsskyldigheten (köparen betalar in momsen) för att bekämpa momsbedrägerier. Tjeckien förespråkade möjligheten att använda den omvända momsskyldigheten på flera varuområden, medan andra länder, som Sverige, motsatte sig denna möjlighet.
Finansministrarna nådde ingen slutsats. I mars ska kommissionen presentera sin handlingsplan på området. Då kommer kommissionen att överväga för- och nackdelar med omvänd momsskyldighet.
Varje år förlorar EU-länderna 170 miljarder euro på grund av momsbedrägerier, sade kommissionens vice ordförande för EMU Valdis Dombrovskis.