Det justerade rörelseresultatet var -1,7 miljarder euro (0,8) och intäkterna uppgick till 1,9 miljarder euro (9,6).
Antalet flighter och passagerare minskade med 94 respektive 96 procent under kvartalet jämfört med samma period föregående år.
I rapporten skriver bolaget att marknaden kommer att vara utmanande under flera år framöver och även om reserestriktioner fortsatt gäller i flera länder börjar efterfrågan stiga. Det syns särskilt på kortare flighter och i turistsegmentet.
I slutet av oktober räknar Lufthansa med att erbjuda omkring 40 procent av förra årets kapacitet.